Page 2 - BİOMEDYA SAYI 12

02 BİYOTEKNOLOJİ VE YAŞAM BİLİMLERİ GAZETESİ Kasım - Aralık 2017 www.biomedya.com

BİYOİNFORMATİĞİN KANSER

ÇALIŞMALARINDAKİ ÖNEMİ

Dr. Ebubekir Dirican | Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ABD. | ebubekir.dirican@marmara.edu.tr

Biyoinformatik, biyolojik bilginin bilgisayar bir hastanın hastalığının moleküler teknisyenlerin işi, kuru laboratuvarda
desteği ile incelenmesi ve işlenmesidir. özelliklerine bakarak bu hastalığın tanı, biyoinformatikçilerin işidir.
İnterdisipliner bir bilim olan biyoinformatik, tedavi ve korunmasında neler yapılması Kanser çalışmalarında bir genetik
biyolojik veriyi depolama teknikleri ve gerektiğini bize söyleyebilmektedir. (mutasyon, amlifikasyon gb) veya
Neredeyse hergün depodan bulma teknikleri geliştirir, Kanser çalışmalarında yeni nesil epigenetik (metilasyon, asetilasyon,
fosforilasyon) anormalliği bir DNA dizi
düzenler ve analiz eder. İlk kez Paulien
birçok yeni bilgi, çalışma Hogeweg tarafından 1970 yılında, canlı teknolojiler sayesinde keşfedilen yeni analiziyle veya bir mikroarray çalışmasıyla
ve makale bilimsel veri sistemlerin bilgisinin incelenmesi sırasında yöntemler ile hem çok detaylı bilgiler elde ortaya çıkarmak sadece ufak bilimsel
tabanlarında (PUBMED, biyoinformatikten yararlanıldı. Daha sonra edilebilmektedir. Fakat bu yöntemlere bir yol almaktadır. Halbuki anormalliğin
2001 yılında ise insan genom projesinin
ulaşamayanların bu yapılmış çalışmaları
altında yatan faktörleri ortaya koymak
Web of Science, Google açıklanması ile önemi ortaya çıkmaya okurken sorun yaşadıkları da bir gerçektir. o çalışmanın değerine değer katacaktır.
Akademik ve Google başladı. 1970’lerde moleküler biyolojiden Çünkü bu yeni yöntemlerde deneyler Tespit edilmiş olan anormalliğin kanser
Scholar gibi) yerini ayrılan biyoinformatiğin 1990’larda ayrı yapıldıktan sonra çeşitli biyoinformatik tanı, tedavi veya prognozundaki önemini
ortaya koymak için biyoinformatik
yöntemlerle de sonuçlarını ortaya
bir bilim dalı olarak kabul edilmesi, hızla
almaktadır. Böylelikle yükselen veri miktarının doğurduğu ihtiyaç koymanız gerekmektedir. Bu yüzden analizlere ihtiyaç duyulmaktadır. Yapılan
çok geniş ve çok büyük ve bir o kadar hızla yükselen bilgisayar bu bilginin kalitesini görebilmemiz bilimsel çalışmalar çoğunlukla yapılan
bir bilgi bankası oluşmuş teknolojisinin sunduğu imkanlar ile biyorinformatik belleğinize bağlıdır. yeri ilgilendiren bir sorun da olabiliyor.
gerçekleşti.
Çünkü biyoinformatik çalışmalar bize
Bu yüzden bulduğunuz şeylerin dünya
durumdadır. Fakat bu öyle inanılmaz veriler sunmaktadır ki, genelindeki resmini ortaya çıkarmanız
çalışmaların tek tek Bilimsel bilginin yer bulduğu veri tabanları bazen kurgulamamız bile zordur. Örneğin ancak biyoinformatikle mümkündür.
analizlerini yapmaya sayesinde bazen hiçbir ek laboratuvar biyoinformatik görüntüleme analizleri, Sonuç olarak, biyoinformatik ne
çalışmasına gerek duymaksızın mevcut
bazen bir genden sentezlenen proteinin
ve yorumlamaya bilgiden kurduğumuz hipotezlerin kompleks şekillerini verebilmekte veya kadar insanın üstünde duran elbise
çalışsak ömrümüz yanıtlarına ulaşmamız çok kolay hale bazen DNA’ya bağlanan bir molekülün gibi görünüyor olsa da, o elbisenin de
yetmez! Bu yüzden gelmiştir. Fakat bu yanıt bulduğumuz akıbetini gösterebilmektedir. Bilim insanları çeşitleri, incelikleri ve özellikleri olduğunu
verilerin bilimsel değer taşıması için ek
da bu analizler sayesinde hangi hastalığa
bilmekteyiz. Herkes üstüne uyan, yakışan
biyoinformatik bilimine biyoinformatik çalışmalara ihtiyaç vardır. hangi anormalliklerin sebep olduğunu ve en güzelini bulmaya ve almaya çalışır.
başvurmaktayız. Özellikle tıp, biyoloji gibi sağlık alanlarında rahatlıkla gösterebilmektedir. Bununla İşte biyoinformatik yöntemlerin de birçok
ve biyomühendislikte biyoinformatiğin birlikte, bazen bir kanser vakasında farklı çeşidi (COSMIC, Oncomire, FIREHOSE,
önemi yadsınamaz bir gerçektir. Bu mevcut bir mutasyonun ilgili gendeki yerini ve cBioportal gibi) vardır. Eğer siz çalışmanız
bilgilerin hastalıkların biyolojik temelini etkisini görmemiz bile mümkündür. Kısaca için uygun, doğru ve en önemlisi de
ortaya çıkarmada rol aldığı bilinmektedir. özetleyecek olursak, tümörü tanımlamak, güvenilir olanı seçerseniz işte o zaman
Öncü tıp, mevcut bilgiden yola çıkarak, ıslak laboratuvarda uzmanların/ çalışmanızın bir değeri olacaktır.