Araştırma
10 Bin Metre Derindeki Mikropların Hayatta Kalma Sırrı
Yongxin Lv, Peiyu Liu, Yan Liu, Liang Dong, Jinhua Li, Yu Zhang ve ekip arkadaşları, insanlı Fendouzhe denizaltısıyla alınan tortu örneklerinde RNA’yı yerinde sabitledi. Bu yaklaşım, yüzeye çıkarma sırasında metabolik ifadenin değişmesini sınırlayıp mikroorganizmaların doğal durumuna daha yakın genomik ve transkriptomik veri elde edilmesini sağladı.
Araştırmacılar 1.369 metagenomla birleştirilmiş genom yeniden oluşturdu. Baskın heterotrofik soyların peptidoglikan ve beta-1,4-mannan gibi karmaşık makromolekülleri hedefleyen karbonhidrat aktif enzimleri kodladığı görüldü. Bu parçalama faaliyetleri, oksijen, nitrat ve nitriti elektron alıcısı olarak kullanabilen esnek solunum yollarıyla transkripsiyon düzeyinde eşleşti.
Gen ortak ifade analizleri ve mikrobiyal birlikte bulunma ağları, redoks katmanlaşmasının farklı nişler oluşturduğunu gösterdi. Çukurun yamaç toplulukları oksidatif yolları tercih ederken taban topluluklarında denitrifikasyon ve N2O indirgenmesi dahil indirgen metabolizmalar zenginleşti. Tür bileşimi farklı olsa da iki habitatta da makromolekül geri dönüşümü ve redoksa bağlı solunum temel ortak strateji olarak korundu.
Bulgular, derin deniz karbon ve azot döngülerinin pasif olmadığını; organik maddenin yeniden mineralizasyonunda güçlü mikrobiyal ağların çalıştığını gösteriyor. Çalışma belirli bir çukurun tortullarına dayanıyor ve diğer hadal bölgelerin aynı yapıyı taşıdığı varsayılamaz. Araştırma Çin’in ulusal programları, Shanghai Jiao Tong University ve ilgili bilim fonları tarafından desteklendi; hesaplamalar Siyuan-1 kümesinde yürütüldü.
